家蚕微孢子虫全基因组分泌蛋白的预测分析

• 作者: 党晓群 刘显林 周泽扬 康定荣 李田 潘国庆 秦国伟 韩冰 齐晓冉
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 家蚕微孢子虫 基因组 分泌蛋白 信号肽 基序
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 295-301
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.115+.92|Q811.4
• 语种: 中文

摘要

分泌蛋白是一类重要的介导病原与宿主相互作用的因子.微孢子虫专性细胞内寄生的生活方式决定了分泌蛋白在其侵染、增殖、防御和调控宿主生理活动中具有重要的作用.利用真核生物分泌蛋白预测流程EuSecPred 1.0对家蚕微孢子虫全基因组的分泌蛋白基因进行预测和严格条件筛选,鉴定获得97个分泌蛋白基因,占基因组全部编码基因的1.87％.对分泌蛋白的功能和结构域进行注释分析,发现了孢壁蛋白、丝氨酸蛋白酶抑制剂(Serpin)和Ricin B-凝集素等重要侵染相关因子.氨基酸组成分析表明,家蚕微孢子虫分泌蛋白及其信号肽主要由疏水性氨基酸组成,而信号肢剪切位点主要由亲水性氨基酸组成.基序分析发现,分泌蛋白信号肽中存在保守基序T[ILV][IVL][LI][VIL][LI] LS[IV]I[AK][SA],分泌蛋白内部存在[ES]W[VLM]K和YF[FY][DG]L2种基序.在全基因组范围对家蚕微孢子虫的分泌蛋白进行预测分析,有助于进一步研究家蚕微孢子虫致病相关的候选因子.