棒花鱼(鲤形目,鲤科)全线粒体基因组测定与分析

• 作者: 尤平 王佳 贺怀亚
• 来源期刊: 动物分类学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 棒花鱼 线粒体基因组 长PCR 鲤科
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 页码范围: 695-704
• 分类号: Q959.468
• 语种: 中文

摘要

采用长聚合酶链式反应(L-PCR),以L-PCR扩增产物为模板,用30对短PCR引物进行2次PCR(Sub-PCR)扩增,测定并注释了棒花鱼全线粒体基因组.结果表明:棒花鱼线粒体基因组全长16 597 bp,A+T含量55.7％,基因组成及排列顺序与其它硬骨鱼类一致,包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因和1个控制区(D-loop).L链编码1个蛋白质编码基因(ND6)和8个tRNA基因(tRNA-Gln,tRNA-A1a,tRNA-Cys,tRNA-Asn,tRNA-Tyr,tRNA-Ser,tRNA-Glu,tRNA-Pro),其余基因由H链编码.棒花鱼线粒体基因排列紧密,基因间隔12处60 bp,间隔长度1～31bp不等；基因重叠区7处24bp,重叠区碱基覆盖数在1～7 bp之间.13个蛋白质编码基因中,除COⅠ的起始密码子为GTG外,其余均为ATG；8个蛋白质编码基因的3'端为完全终止密码子TAG(ND1、ND2、ND6)和TAA(COⅠ、ATP8、ATP6、ND4L、ND5),其余5个基因均为不完全终止密码子TA (ND3、ND4)和T(COⅡ、COⅢ、Cyb).除tRNA-Ser (AGY)基因外,其余21个tRNA基因二级结构均为典型的三叶草型.控制区(D-loop)位于tRNA-Pro和tRNA-Phe基因之间,长928 bp,控制区有3个结构区:终止序列区(TASs),中央保守区(CSBs)和保守序列区(CSB-1、CSB-2、CSB-3).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王佳	陕西师范大学生命科学学院	19	68	4.0	8.0
2	尤平	陕西师范大学生命科学学院	23	122	5.0	10.0
3	贺怀亚	陕西师范大学生命科学学院	3	11	2.0	3.0