油桐β-酮脂酰-CoA合成酶(KCS)基因的克隆与序列分析

• 作者: 刘美兰 周俊琴 谭晓风 龙洪旭
• 来源期刊: 经济林研究
• 学科: 农学
• 关键词: 油桐 β-酮脂酰-CoA合成酶 Vf_KCS 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 52-57
• 分类号: S603.2|S794.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-8981.2013.04.008

摘要

为给油桐β-酮脂酰-CoA合成酶基因(KCS)结构和功能的研究提供参考,以油桐种子为材料,根据油桐转录组测序分析结果设计引物,利用RT-PCR技术克隆KCS基因,并进行了序列分析.获得了1条KCS基因的全长cDNA,命名为Vf_CS.KCS基因的CDS长度为1 338 bp,编码446个氨基酸.该基因编码的蛋白质具有3个酶活性位点、6个产物结合位点、5个丙二酰-CoA结合位点和多个二聚体形成位点;Vf KCS有2个明显的跨膜螺旋拓扑结构和3个疑似跨膜螺旋拓扑结构;二级结构主要由α-螺旋、β-折叠和不规则卷曲构成,该蛋白为亲水性蛋白.Vf_KCS编码的氨基酸序列与其它物种的KCS氨基酸序列具有较高的相似性,其中与葡萄的KCS基因相似度最高达89.69％,与其它植物的KCS基因所编码的氨基酸同源性大多在80％以上.进化树分析结果表明,Vf KCS与拟南芥亲缘关系最为接近.预测分析结果表明,该酶有高度保守的催化区域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭晓风		4	21	4.0	4.0
3	周俊琴		1	6	1.0	1.0
9	刘美兰		1	6	1.0	1.0
13	龙洪旭		1	6	1.0	1.0