桑树查尔酮合成酶基因（CHS）的生物信息学分析

• 作者: 殷培峰 牛瑞鹤 王晶 谈建中 闫俊芳 陈驰
• 来源期刊: 农业科学与技术（英文版）
• 关键词: 桑树 查尔酮合成酶基因 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 分子生物学?组织培养
• 页码范围: 1209-1211,1214
• 页数: 4页
• 字数: 893字
• 语种: 英文

摘要

[目的]探讨桑椹色素代谢调控的分子机理。[方法]本研究以桑科植物的 EST数据库为基础，采用生物信息学实验技术，通过电子克隆方法获得了桑树查尔酮合成酶基因(CHS)。采用生物信息学在线软件，进一步对该基因编码蛋白的氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构等方面进行了预测和分析。[结果]经 DNAstar软件拼接后得到的 cDNA序列为1365 bp，其开放阅读框序列为1170 bp，编码389个氨基酸残基。 CHS 蛋白含有查尔酮合酶家族的特征多肽序列 RLMMYQQGCFAGGTVLR，不含信号肽序列，属于非分泌型蛋白，定位于细胞质内，分子进化也较为保守。[结论]该研究结果为深入研究该蛋白的结构和功能奠定了基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谈建中	苏州大学建筑与城市环境学院	90	968	17.0	27.0
2	牛瑞鹤	苏州大学建筑与城市环境学院	9	23	3.0	4.0
3	陈驰	苏州大学建筑与城市环境学院	12	27	3.0	4.0
4	殷培峰	苏州大学建筑与城市环境学院	48	207	8.0	12.0
6	闫俊芳	苏州大学建筑与城市环境学院	3	18	2.0	3.0
7	王晶	苏州大学建筑与城市环境学院	23	89	5.0	9.0