石榴查尔酮合成酶蛋白的生物信息学分析

• 作者: 冯立娟 唐海霞 尹燕雷 李英朋 杨雪梅 鹿英
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 石榴 花青苷 查尔酮合成酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术·遗传育种·种质资源
• 页码范围: 7-12
• 页数: 6页
• 分类号: S665.403
• 字数: 2389字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2019.02.002

摘要

本研究用生物信息学方法对石榴及其他19个物种CHS蛋白的系统进化和motif元件进行分析,重点预测分析石榴、巨桉和拟南芥CHS蛋白的理化性质、氨基酸组成、磷酸化位点和二级结构.结果 表明,石榴与巨桉亲缘关系最近,与拟南芥最远.石榴、巨桉和拟南芥CHS蛋白由20种氨基酸组成,数量和比例存在差异,石榴和拟南芥中亮氨酸数量最多,巨桉中丙氨酸最多;存在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸3个磷酸化结合位点,多数发生在苏氨酸和丝氨酸位置上;二级结构由α-螺旋、延伸链、无规则卷曲和β-转角构成,α-螺旋和无规则卷曲占比较高.在20个物种CHS蛋白的motif元件中,石榴CHS蛋白motif数量和位置与巨桉完全一致,与大多数物种相似,与拟南芥差异较大.本研究结果可为深入研究CHS生物学功能及其调控石榴果实呈色的机理提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯立娟		108	718	15.0	21.0
2	尹燕雷		125	931	17.0	25.0
3	杨雪梅		36	170	7.0	11.0
4	唐海霞		13	6	2.0	2.0
5	李英朋		3	3	1.0	1.0