玫瑰查尔酮合酶CHS基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 赵兰勇 齐宇
• 来源期刊: 农学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 玫瑰 查尔酮合酶基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 农业工程/农业机械/生物技术/食品科学
• 页码范围: 91-96
• 页数: 6页
• 分类号: Q781
• 字数: 4377字
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在克隆玫瑰查尔酮合酶CHS基因并对其进行生物信息学分析,以期为利用基因工程技术改变玫瑰花色、培育玫瑰新品种奠定良好基础.以玫瑰品种‘唐红’(Rosa rugosa‘Tanghong’)为试材,采用RT-PCR和RACE方法从花瓣中获得了玫瑰查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)基因的cDNA全长.经生物信息学分析,该基因全长]416 bp,开放阅读框1167 bp,编码389个氨基酸,其蛋白的分子式为C1899H3043N505O562S18,相对分子质量为42.518kDa,等电点为6.12.该蛋白不稳定系数低于40,为稳定性蛋白,无信号肽和剪切位点存在.其蛋白质二级结构主要由42.16％的a螺旋、29.05％的随机卷曲、10.54％的β转角和18.25％的延伸链组成.系统进化分析表明,玫瑰CHS基因与同科植物月季、草莓亲缘关系最近,与其他科及同科其他属植物的亲缘关系较远.本研究首次克隆了玫瑰CHS基因,获得了其生物信息学相关信息,探明了CHS基因在类黄酮生物合成过程中的重要作用,为改良玫瑰花色提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵兰勇	山东农业大学林学院	106	1466	22.0	32.0
2	齐宇	山东农业大学林学院	3	15	2.0	3.0