利用cDNA-AFLP分析内生解淀粉芽胞杆菌Fy11诱导辣椒差异表达基因

• 作者: 杨瑞先 胡方平 范晓静 蔡学清 邱思鑫
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 辣椒 内生解淀粉芽胞杆菌 互作 基因表达 cDNA-AFLP qRT-PCR
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 2449-2458
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.12.006

摘要

[目的]分析内生解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)Fy11诱导辣椒(Capsicum annuum)幼苗差异表达基因,了解辣椒与内生芽胞杆菌互作的分子机制.[方法]利用cDNA-AFLP技术,采用256对引物,分析辣椒幼苗接种内生解淀粉芽胞杆菌Fy11后5个时间点的基因表达谱；利用qRT-PCR分析差异基因表达模式,验证cDNA-AFLP表达谱.[结果]256对引物共产生18620个转录本(TDF),筛选获得353条差异表达条带,占扩增条带总数的1.89％.经克隆、测序分析,最终获得257个差异TDF,聚类分析得到229个独立基因(EST,unigenes),其中144个基因上调表达,85个基因下调表达.经Blastx比对和功能分类分析,其中65条EST(28.38％)未找到同源性匹配,8条(3.49％)与未知功能蛋白同源性较高.其余156条EST主要涉及基础代谢基因(10.92％);与能量和抗病与防御类相关基因,各占8.73％；信号转导基因占7.42％；转运子或转座子基因占6.99％；与细胞结构相关基因占6.55％；参与转录调控基因占5.68％；细胞生长类基因占3.93％；参与蛋白质运输和储存有8个基因,占3.49％；蛋白质合成类基因占2.18％；次生代谢类和胞间运输类基因,其数量相对较少,各占1.75％.选取与抗病防御、转录调控及信号转导类等相关的10个差异基因,qRT-PCR分析结果显示其表达模式符合cDNA-AFLP表达谱.[结论]内生细菌与植物互作的分子机制涉及植物多方面生理生化反应,包括抗病防御、转录调控、蛋白质代谢、信号转导、以及非生物胁迫等多种途径相关基因的协同控制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡方平	福建农林大学植物保护学院	78	2461	27.0	48.0
2	蔡学清	福建农林大学植物保护学院	40	1445	17.0	38.0
3	邱思鑫	福建省农业科学院作物研究所	36	367	10.0	17.0
4	范晓静	福建农林大学植物保护学院	14	160	8.0	12.0
5	杨瑞先	福建农林大学植物保护学院	5	30	4.0	5.0