应用DGGE分析秸秆日粮对奶牛瘤胃细菌群落的影响

• 作者: 卜登攀 卢玉飞 孙鹏 王丹丹 王加启 胡小丽 赵圣国 赵静雯 金迪
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 秸秆 粗饲料类型 瘤胃 细菌群落 DGGE
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·资源昆虫
• 页码范围: 1025-1035
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.05.018

摘要

[目的]通过与苜蓿日粮比较,揭示秸秆日粮模式下瘤胃固液相细菌群落的独特结构.[方法]选择12头健康且体重相似的装有永久瘤胃瘘管的中国荷斯坦奶牛,分别饲喂以玉米秸秆(CS)和苜蓿、羊草、青贮玉米三者混合物(MF)为粗饲料组成的日粮,正饲期第1 3周连续3d分12个时间点采集瘤胃固、液相内容物样品.提取微生物DNA后,利用PCR结合变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)分析细菌群落结构,并进行聚类分析及差异条带的测序分析.[结果]与MF组相比,CS组奶牛瘤胃固、液相细菌DGGE图谱条带的数目和光密度均有一定差异,两处理组都各有一些稍显优势的条带,CS组优势条带要少于MF组.与MF组相比,CS组液相细菌的香浓多样性指数无差异(P＞0.05),固相细菌香浓多样性指数显著降低(P＜0.01)；通过对差异条带进行测序,发现与MF组相比,CS组中瘤胃细菌Prevotella sp.、Acetivibrio ethanolgignens和clostridium sp.减少,并且大量来源于Bacteroidetes、Firmicutes、Tenericutes和Proteobacteria等菌门的未培养细菌有所变化.[结论]秸秆日粮条件下奶牛瘤胃存在独特的细菌群落结构,细菌多样性较低.