菊芋SSR-PCR反应体系优化及3个品种的分子鉴别

• 作者: 任鹏鸿 李莉 韩睿 马胜超
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 菊芋 SSR-PCR 优化 引物筛选 分子鉴别
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 园艺·食品加工
• 页码范围: 2441-2446
• 页数: 6页
• 分类号: S632.3
• 字数: 3864字
• 语种: 中文

摘要

本研究通过单因子优化试验和L16 (45)正交试验设计的方法,对菊芋SSR-PCR反应体系进行优化.结果表明,20ul最佳反应体系:10×PCR扩增缓冲液,2.5 mmol/L Mg2+,0.20 mmol/L dNTPs,0.30 μmol/L正反引物,0.2 U Taq DNA聚合酶和50 ng模板DNA.利用该优化体系,从100个SSR引物组合中筛选出12个清晰且多态性高的引物组合对3个品种的菊芋DNA序列进行扩增,得到58个位点,其中多态性位点39个,多态率为67.2％;建立3个菊芋品种分子识别卡,用2对引物组合的6个多态性位点即可将其分开.本研究为后续应用SSR分子标记技术对菊芋进行种质资源分子遗传学方面的研究提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李莉	青海省农林科学院菊芋研发中心青海省蔬菜遗传与生理重点实验室	43	393	11.0	17.0
2	韩睿	青海省农林科学院菊芋研发中心青海省蔬菜遗传与生理重点实验室	11	92	7.0	9.0
3	任鹏鸿	青海省农林科学院菊芋研发中心青海省蔬菜遗传与生理重点实验室	2	23	2.0	2.0
4	马胜超	青海省农林科学院菊芋研发中心青海省蔬菜遗传与生理重点实验室	2	23	2.0	2.0