栉孔扇贝BAC文库的构建及质量评价

• 作者: 于娜 包振民 程洁 赵柏淞 陈亮 黄晓婷
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 栉孔扇贝 BAC文库 基因组
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 57-63
• 页数: 7页
• 分类号: S197
• 字数: 4829字
• 语种: 中文

摘要

本研究构建了栉孔扇贝3个BAC文库,分别为BamHⅠ文库,HindⅢ文库和Sau3AⅠ,其中BamHⅠ文库包含34560个克隆,平均插入片段为98 kb,未发现空载;HindⅢ文库包含132480个克隆,平均插入片段为106 kb,空载率为1.67％;Sau3AⅠ文库包含23040个克隆,平均插入片段为53 kb,空载率为3.33％.3个文库总共由190080个克隆组成,平均插入片段为98 kb,覆盖栉孔扇贝基因组的15.4倍.通过对随机挑选BAC克隆100代的继代培养,未发现插入片段的丢失或重排现象,说明所构建的BAC文库是稳定的.将所有克隆进行超级池及二级池的构建,筛选了3个基因及遗传图谱上的7个微卫星标记,阳性克隆数在6～18之间,表明这3个文库可以在目的基因或标记的筛选、物理图谱的构建及大规模基因组的测序中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄晓婷	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	7	126	6.0	7.0
2	包振民	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	63	1149	20.0	32.0
3	陈亮	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	12	35	3.0	5.0
4	于娜	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	2	3	1.0	1.0
5	赵柏淞	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	3	8	2.0	2.0
6	程洁	中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室	1	3	1.0	1.0