海洋微生物ZD02信号降解酶基因aiiA克隆及其生物信息学分析

• 作者: 丁贤 周世宁 孙威文 张殿昌 林黑着 翁雄
• 来源期刊: 生态学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 海洋细菌 群体感应信号降解酶 aiiA基因
• 年，卷（期）: 2013,（8）
• 页码范围: 2056-2061
• 分类号: Q938
• 语种: 中文

摘要

根据细菌群体感应信号降解酶(AiiA)基因设计简并引物,从海洋微生物ZD02基因组中扩增编码AiiA的基因aiiA,筛选其阳性克隆,测序后分析其基因序列.结果表明:筛选到的阳性克隆ZD02-aiiA序列全长753 bp(Genbank登录号:KC756214),存在一个开放阅读框(ORF),编码由250个氨基酸残基组成的多肽,预测分子量为28.1 kDa,蛋白等电点为4.78.由该序列推导得到的氨基酸残基序列含有一个保守结构域(Lactamase-B) (34AA～235AA),并预测了AiiA的三级结构.以上研究为该序列的重组表达及其相关活性研究奠定了基础.