PR(+)/PR(-)乳腺癌差异表达microRNAs潜在作用通路的生物信息学分析

• 作者: 吴钢 姜茂竹 张积仁 曾融 郑燕芳 麦仲伦
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 乳腺癌 孕激素受体 microRNAs 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 硕博专栏论著
• 页码范围: 8-12
• 分类号: R737.9
• 语种: 中文

摘要

目的 通过对乳腺癌中与孕激素受体(PR)状态相关的microRNAs差异表达谱进行生物信息学分析,探讨microRNAs在PR表达状态中可能参与的调控机制,为深入研究乳腺癌不同分子亚型的分化提供新思路.方法 利用文献挖掘方法找到与PR状态相关的microRNAs差异表达数据集,然后利用生物信息学方法(Targetscan软件和DAVID数据库)预测microRNAs的靶基因,再对靶基因进行基因本体论(GO)富集和通路分析.结果 通过文献挖掘找到3个差异表达microRNAs数据集,生物信息学分析获得3个相应靶基因集和1个靶基因合集.靶基因的GO分类主要涉及细胞内的信号级联、蛋白氨基酸磷酸化、蛋白质甲基转移酶活性及转录因子活性等生物学过程及分子功能.通路分析发现3条KEGG信号通路和3条BIOCARTA代谢通路可能参与不同PR表达状态的调节.结论 通过生物信息学方法,初步分析了microRNAs在不同PR表达状态中可能参与调控的信号和代谢通路,为进一步探索microRNAs在乳腺癌不同分子亚型分化的调控机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张积仁	南方医科大学附属珠江医院肿瘤中心	167	747	12.0	19.0
2	郑燕芳	南方医科大学附属珠江医院肿瘤中心	27	103	6.0	8.0
3	曾融	南方医科大学附属珠江医院肿瘤中心	8	12	2.0	3.0
4	姜茂竹	南方医科大学附属珠江医院肿瘤中心	13	19	2.0	3.0
5	麦仲伦	南方医科大学附属珠江医院肿瘤中心	7	17	2.0	3.0
6	吴钢	南方医科大学附属珠江医院肿瘤中心	8	29	3.0	5.0