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基于cDNA-AFLP发掘茶树被茶尺蠖取食诱导的相关差异基因及其表达特征
基于cDNA-AFLP发掘茶树被茶尺蠖取食诱导的相关差异基因及其表达特征
作者:
上官明珠
曹士先
盛亮
程曦
蒋正中
邓威威
韦朝领
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
茶树
茶尺蠖
取食诱导
cDNA-AFLP
防御机制
摘要:
[目的]发掘茶树被茶尺蠖取食诱导的相关防御基因及其分子防御机制.[方法]利用cDNA-AFLP筛选茶树叶片被其主要害虫茶尺蠖取食后差异表达片段(transcript-derived fragment,TDF),并对其进行生物信息学分析和相关验证;运用qRT-PCR(quantitative real-time PCR)研究部分差异基因的表达规律.[结果]茶树被茶尺蠖取食后,共发现231条TDF,经PCR验证和测序后,成功获得134条EST (expressed sequence tags)序列,其中上调与下调表达的TDF数量分别为81和53条,各占测序获得序列的60.4%与39.6%;利用BLASTx在GenBank进行比对与功能分析可知,其中的23.1%与代谢相关,9.0%跟光合作用与能量相关,跟蛋白质合成与贮藏相关的序列各占8.2%,与信号转导相关的占6.0%,跟抗病与防御相关的占5.2%,但与细胞生长及细胞结构、转录因子和运输相关的数量很少,分别为1.5%、2.2%和3.0%;此外,还有6.7%的TDF功能不明确,有20.1%的无同源性序列;利用qRT-PCR(quantitative real-time PCR)对TDF 21F1、22D、27L3和28F分别进行了表达特征分析,结果表明这4个TDF代表的基因在茶树被茶尺蠖取食后均有不同程度诱导.[结论]通过cDNA-AFLP技术发掘了多个茶树被茶尺蠖取食诱导的差异表达基因片段,初步揭示了茶树被害虫取食而诱导的分子防御机制.
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文献信息
篇名
基于cDNA-AFLP发掘茶树被茶尺蠖取食诱导的相关差异基因及其表达特征
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
茶树
茶尺蠖
取食诱导
cDNA-AFLP
防御机制
年,卷(期)
2013,(19)
所属期刊栏目
园艺
研究方向
页码范围
4119-4130
页数
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2013.19.018
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取食诱导
cDNA-AFLP
防御机制
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研究来源
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研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
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