苦瓜果实S-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因McSAMDC的克隆、表达及亚细胞定位

• 作者: 林义章 潘东明 许端祥 钟开勤 陈桂信 高山
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苦瓜 S-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因 亚细胞定位 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种、作物营养与栽培
• 页码范围: 838-844
• 页数: 7页
• 分类号: S642.5
• 字数: 4651字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2013.05.007

摘要

根据已构建苦瓜果实均一化文库中获得的1个与SAMDC基因相关的EST序列,采用3′RACE技术,克隆获得1个苦瓜SAMDC基因的cDNA全长序列,命名为McSAMDC(GenBank登录号为KC632099).生物信息分析结果表明,该cDNA全长l900bp,5′UTR和3′UTR分别长501、325bp.该cDNA序列存在3个开放读码框(微型tORF、上游读码框uORF和主读码框mORF),其中mORF长1077bp,编码358个氨基酸,预测分子量为39.31ku,含有酶原剪切位点结构域和蛋白快速降解有关的PEST二个保守结构域.二级结构分析显示,McSAMDC含有无规卷曲(45.53％)、α-螺旋(29.33％)、伸展链(19.83％)、β-转角(5.31％).序列分析结果表明,McSAMDC与拟南芥(CAA69073.1)、琴叶拟南芥(XP002882231.1)和雪里红(AAS45435.1)的氨基酸序列相似性分别达到69％、68％和68％.亚细胞定位结果表明,McSAMDC定位在细胞质中.荧光定量结果表明,McSAMDC在果实膨大期表达量最高,并随之迅速下降,并从成熟初期至完全成熟期该基因表达量逐渐增大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高山	福建农林大学园艺产品贮藏保鲜研究所	15	226	9.0	15.0
3	林义章	福建农林大学园艺学院	77	941	15.0	27.0
4	潘东明	福建农林大学园艺产品贮藏保鲜研究所	201	1594	19.0	27.0
7	陈桂信	福建农林大学园艺产品贮藏保鲜研究所	59	447	13.0	18.0
8	许端祥		35	108	6.0	9.0
9	钟开勤		15	37	3.0	5.0