天祝白牦牛GDF-10基因CDS区的多态性及生物信息学分析

• 作者: 刘建 吴晓云 李天科 梁春年 秦文 裴杰 郎侠 阎萍
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 天祝白牦牛 GDF-10基因 多态性 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 79-85
• 语种: 中文

摘要

采用DNA混合池测序法检测天祝白牦牛生长分化因子-10(Growth differentiation factor 10,GDF-10)基因编码区的多态性,应用生物信息学方法分析天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质特性.结果表明,天祝白牦牛生长分化因子-10基因编码区序列存在8个突变位点,其中90C→G、124C→G、1005G→A和1232G→C为错义突变,导致了编码氨基酸的改变,132T→C、822A→G、873G→T和888T→C为同义突变;天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质的氨基酸序列没有明显的疏水性区域和跨膜螺旋区;其存在信号肽,说明可能在细胞质中发挥生物学作用;天祝白牦牛生长分化因子-10编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主;氨基酸序列与普通牛的同源性为99.4％,与人、小鼠、大鼠4个物种间同源性较高.