甘南牦牛GDF-10基因多态与生产性状的相关性分析

• 作者: 吴晓云 李天科 梁春年 秦文 裴杰 褚敏 郎侠 阎萍
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 牦牛 GDF-10基因 多态性 高分辨率溶解曲线 单倍型 生产性状
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧?兽医?资源昆虫
• 页码范围: 161-169
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.01.017

摘要

[目的]GDF-10基因又称作骨形成蛋白3b，最早通过骨形成蛋白寡聚核苷酸序列的PCR扩增所得，与骨骼的形成和发育有关。很多研究已经表明GDF-10基因在骨骼的形态变化过程中发挥着重要作用。本实验通过研究甘南牦牛GDF-10基因多态性与生产性状间的相关性，证明GDF-10基因与骨骼发育的相关性，发现与牦牛生产性状相关的分子标记，为加快牦牛选育进程，提高牦牛生产性能提供参考。[方法]以298头甘南牦牛血样为材料，随机选取其中的30个DNA样混合组成DNA池，设计9对引物对GDF-10基因外显子1，2和3进行扩增，扩增产物经琼脂糖凝胶回收后测序。运用BLAST 和Chromas软件通过测序峰图找出突变位点，然后采用高分辨率熔解曲线分析技术（high resolution melting curve，HRM）进行基因型分型和统计等位基因频率。采用SHEsis和PHASE软件对GDF-10基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析，采用SPSS17.0进行基因多态位点与生产性状关联性分析。[结果]检测到甘南牦牛GDF-10基因外显子3的3个多态位点12116（G/A）、12152（C/T）、和13041（T/C）。群体遗传学分析显示，3个多态位点均表现为低度多态（PIC＜0.25）；χ2检验表明牦牛群体在13041（T/C）位点未达到Hardy-Weinberg平衡（P＜0.05），其它两个多态位点处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＞0.05）；多态位点配对连锁不平衡分析发现，三个突变位点之间存在弱连锁平衡；关联分析表明，甘南牦牛GDF-10基因不同突变位点的基因型与体斜长、体高、胸围、体重差异显著或极显著（P＜0.05或P＜0.001），与管围差异不显著（P＞0.05）；单倍型分析后在群体中发现了7种单倍型组合，其中ATC和ATT组合与牦牛的体尺性状和体重显著相关。[结论]甘南牦牛GDF-10基因3个多态位点和两个单倍型组合与牦牛的体高、体长、体重和胸围显著相关，可以尝试作为牦牛生产性状的候选分子标记，为牦牛遗传资源的保护、开发与新品种的选育提供科学依据。