西瓜半胱氨酸蛋白酶基因ClCP1克隆及其生物信息学分析

• 作者: 孙玉宏 张娜 施先锋 曾红霞 程维舜 阳永学
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 西瓜 ClCP1 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（28）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 11286-11288,11319
• 页数: 4页
• 分类号: S651
• 字数: 3378字
• 语种: 中文

摘要

[目的]克隆西瓜半胱氨酸蛋白酶基因ClCP1,并对其进行生物信息学分析.[方法]以西瓜花蕾cDNA为模板,借助西瓜全基因组数据库,采用RT-PCR方法对西瓜半胱氨酸蛋白酶基因进行克隆并进行生物信息学分析.[结果]克隆得到一个开放阅读框长度为960bp的序列,命名为ClCP1.该基因编码319个氨基酸.ClCP1基因的保守结构域分析结果表明,ClCP1属于木瓜蛋白酶家族基因,与已知其他植物半胱氨酸蛋白酶在氨基酸序列上有56％ ～ 85％的相似性.聚类分析结果显示,ClCP1与同为葫芦科的黄瓜CP基因亲缘关系较近.[结论] ClCP1属于西瓜木瓜蛋白酶家族新基因,为进一步研究西瓜半胱氨酸蛋白酶基因ClCP1的表达和功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙玉宏		58	356	9.0	15.0
2	施先锋		36	158	6.0	9.0
3	曾红霞		33	171	7.0	10.0
4	张娜		20	67	6.0	6.0
5	程维舜		17	51	4.0	6.0
6	阳永学		6	10	2.0	3.0