一种基于改进Segal模型的核小体定位方法

• 作者: 王加俊 黄星
• 来源期刊: 数据采集与处理
• 学科: 生物学
• 关键词: 核小体定位 二核苷酸位置频率 连接DNA序列 核心DNA序列
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 页码范围: 141-145
• 页数: 5页
• 分类号: Q34
• 字数: 3349字
• 语种: 中文

摘要

核小体预测是目前遗传学研究的重要内容,但现有的预测算法大部分仅依据核小体的统计特性,定位准确性很受局限.另一方面,经研究发现,DNA连接序列作为两个核小体的连接纽带,存在一定的统计特性.基于此事实,本文对Segal模型做了改进,通过核小体和连接序列的二核苷酸位置频率建立了核小体和连接序列两组得分函数,并以其差值作为核小体的定位依据.利用该算法模型对酵母染色体中核小体进行定位预测,发现定位准确性得到明显提高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王加俊	苏州大学电子信息学院	66	515	12.0	19.0
2	黄星	苏州大学电子信息学院	5	13	2.0	3.0