猪240日龄GLU和GSP含量的全基因组关联分析

• 作者: 李金花 贾德宏
• 来源期刊: 青海畜牧兽医杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 血糖 糖基化血清蛋白 QTL定位
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 4-6
• 页数: 3页
• 分类号: S828
• 字数: 3535字
• 语种: 中文

摘要

通过检测苏太猪群体和白色杜洛克×二花脸F2资源家系猪群体240日龄血浆血糖(Serum glucose,GLU)和糖基化血清蛋白(glycosylated serum proteins,GSP)含量,应用全基因组关联分析影响猪血糖性状的数量性状位点(QTL),并搜寻QTL区间内与表型相关的位置候选基因,为最终鉴别因果基因莫定前期工作基础.屠宰240日龄苏太群体435头和白色杜洛克×二花脸F2资源家系760头,收集血清并检测血糖和糖基化血清蛋白指标,利用mm porcine 60K SNP芯片判定个体的基因型,并进行全基因组SNP与两个性状关联性分析,定位影响苏太猪和白色杜洛克×二花脸F2资源家系个体240日龄血糖和糖基化血清蛋白的QTL.在Ensembl(EMBI-EBI)和NCBI(National Center forBiotechnology Information)网站搜寻相应的位置候选基因.在3条染色体上共检测到1个影响GSP和2个影响GLU的QTL,此外在苏太猪中检测到2个影响GSP的QTL,但这两个显著关联SNP的染色体位置目前尚无结论,所以没有定位到哪条染色体上,这些QTL均为5％染色体显著水平.影响不同性状的QTL位于不同染色体上,影响同一性状的QTL也位于不同染色体上,解释表型变异为3.719％和3.724％.