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大麦籽粒β-葡聚糖含量的全基因组关联分析
大麦籽粒β-葡聚糖含量的全基因组关联分析
作者:
耿腊
黄业昌
李梦迪
谢尚耿
叶玲珍
张国平
原文服务方:
作物学报
大麦
β-葡聚糖
全基因组关联分析
SNP位点
最佳等位基因
摘要:
β-葡聚糖是大麦籽粒的一个重要品质性状, 其含量高低影响大麦啤用、饲用和食用品质。虽然有关大麦β-葡聚糖合成的相关基因已有报道, 但关于大麦籽粒β-葡聚糖积累的遗传调控机制仍不十分清楚。本研究以前期收集的全球119份大麦基因型为材料, 种植在土壤与气候条件有一定差异的两试点, 利用混合线性模型(MLM)和一般线性模型(GLM)对不同大麦材料籽粒β-葡聚糖含量进行GWAS分析。结果表明, 大麦籽粒β-葡聚糖含量的基因型差异显著, 其在2个环境下的广义遗传力为73.9%。利用MLM和GLM模型分别检测到8个和40个显著位点, 合并2个模型重叠位点后共得到44个显著位点, 其中HORVU5Hr1G022710基因在2个模型、2个地点均被鉴定到, 故被认为是与β-葡聚糖含量显著相关的候选基因。2个模型中最佳等位基因数与β-葡聚糖含量均呈显著正相关。此外, 基于基因注释, 共鉴定到10个与糖合成、转运及分解相关的酶类基因, 这些基因可能与籽粒中β-葡聚糖的合成、积累和分解紧密相关。本研究结果为阐明β-葡聚糖的遗传调控机制提供了新的视角, 亦为大麦籽粒β-葡聚糖的遗传改良奠定了一定的理论基础。
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文献信息
篇名
大麦籽粒β-葡聚糖含量的全基因组关联分析
来源期刊
作物学报
学科
关键词
大麦
β-葡聚糖
全基因组关联分析
SNP位点
最佳等位基因
年,卷(期)
2021,(7)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
研究方向
页码范围
1205-1214
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2021.01074
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
版权信息
数据
耿腊-附表1.docx
耿腊-附表2.docx
全文
全文.pdf
引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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节点文献
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2021(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
大麦
β-葡聚糖
全基因组关联分析
SNP位点
最佳等位基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
总被引数(次)
197718
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