基于公共sRNAs库的病毒检测分析研究

• 作者: 徐峰 王亚静 王敏 王珲
• 来源期刊: 天津科技大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 病毒检测 small RNAs 病毒分类 生物信息学 抗病毒免疫 下一代测序
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 【食品与生物技术】
• 页码范围: 35-41
• 页数: 7页
• 分类号: Q-9
• 字数: 3350字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13364/j.issn.1672-6510.2014.05.008

摘要

以公共的small RNAs (sRNAs)新一代测序数据为材料，通过生物信息学的分析方法检测生物实验系统样品中存在的病毒，讨论病毒与宿主间的关系，病毒的种属特性，进而指导生物实验设计。从GEO Datasets数据库下载917个已发表的 sRNAs 高通量测序数据，通过生物信息学分析共检测出来自334个样品库的2,107条高度同源的病毒序列和2,930条疑似的病毒序列。这些病毒主要是正链 RNA 病毒、反转录病毒和双链 DNA 病毒，集中在花椰菜花叶病毒科、反转录病毒科、杆状病毒科和芜菁黄花叶病毒目。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王敏	天津科技大学生物工程学院	75	717	16.0	23.0
2	王亚静	天津科技大学生物工程学院	1	0	0.0	0.0
3	徐峰	南开大学药学院药物化学生物学国家重点实验室	3	1	1.0	1.0