养殖河鲀肠道细菌16S rDNA多样性分析

• 作者: 侯红漫 孙黎明 尹雪梅 庞薇 张公亮
• 来源期刊: 大连工业大学学报
• 学科: 工学
• 关键词: 养殖河鲀 克隆文库 16S rDNA 肠道细菌多样性
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 食品与生物工程
• 页码范围: 316-320
• 页数: 5页
• 分类号: TS201.3
• 语种: 中文

摘要

从养殖河鲀肠道内容物中提取细菌基因组DNA,通过PCR和TA克隆构建了细菌的16S rDNA基因文库研究肠道内容物细菌的多样性.结果表明,大部分序列通过NCBI数据库的BLAST搜索发现相似率为88％～99％,共有8个OTUs的序列相似率小于98％;鉴定出4类系统发育菌群,分别是变形菌门γ亚群(Gamma-Proteobacteria,44.8％)、CFB菌群细菌(Cyto phaga-Flexibacter-Bacteroides,6.9％),厚壁菌门(Firmicutes,13.8％)、Unclassified group (34.5％),其中变形菌门γ亚群为肠道内容物中的优势细菌类群.文库多样性分析结果显示养殖河鲀肠道内容物中有着丰富的细菌多样性群落.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯红漫		65	253	9.0	13.0
2	孙黎明		19	172	8.0	13.0
3	张公亮		49	163	7.0	11.0
4	尹雪梅		1	0	0.0	0.0
5	庞薇		1	0	0.0	0.0