2个大豆RNA依赖的RNA聚合酶基因GmRDR6a和GmRDR6b的克隆与分析

• 作者: 吴冰月 宋普文 崔瑾 许晓明 陈华涛 陈新
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 大豆 基因克隆 组织表达 荧光定量PCR 生物胁迫 非生物胁迫
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 27-34
• 分类号: Q785
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/j.issn.1000-2030.2014.03.004

摘要

利用同源克隆的方法从大豆品种‘科丰一号’中分离出2个RDR6基因,分别将其命名为GmRDR6a和GmRDR6b基因,并对其进行序列分析、植物组织表达以及抗逆境胁迫表达分析.结果表明:GmRDR6a基因位于大豆基因组的6号染色体上,基因全长为4 389 bp,包含一个长度为744 bp的内含子,其ORF长度为3 615 bp,编码1 204个氨基酸,相对分子质量和等电点分别为297.5×103和4.86;GmRDR6b基因位于大豆基因组的4号染色体上,基因全长为4 002 bp,包含一个长度为387 bp的内含子,其ORF长度为3 615 bp,编码1 204个氨基酸,相对分子质量和等电点分别为296.89×103和4.86;GmRDR6a和GmRDR6b都含有RDRs家族的保守序列DLDGD;2个基因在所有被检测组织中均表达,并且在花中的表达量最高;荧光定量结果表明:在大豆花叶病毒(SMV)处理下,2个基因在抗病材料‘科丰一号’中的表达量均显著高于感病材料‘南农1138-2’,在非生物胁迫下,GmRDR6a基因在盐和干旱处理下根、茎、叶组织中的表达量均提高,其中盐处理下根中的表达量最高,ABA诱导条件下出现早期响应,但是在冷害处理下该基因的表达量没有明显变化;GmRDR6b基因在盐、ABA处理下,表达量很高,冷害处理下出现早期响应,但是在干旱条件下,该基因表达趋势不明显.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈新	江苏省农业科学院蔬菜研究所	191	659	12.0	17.0
2	崔瑾	南京农业大学生命科学学院	82	2115	26.0	44.0
3	陈华涛	江苏省农业科学院蔬菜研究所	89	391	9.0	14.0
4	许晓明	南京农业大学生命科学学院	29	532	13.0	22.0
5	吴冰月	南京农业大学生命科学学院	2	8	2.0	2.0
9	宋普文	江苏省农业科学院蔬菜研究所	1	3	1.0	1.0