鸡U6核内小RNA基因的克隆与分析

• 作者: 孙婴宁 李辉 王宁 王维世 高媛
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 核内小RNA 克隆 启动子 鸡
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 17-21
• 页数: 5页
• 分类号: S831.2
• 字数: 4371字
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在获得鸡U6 snRNA的全序列,并对其序列、启动子及拷贝数等进行分析.本实验通过RT-PCR、克隆、测序获得了鸡U6snRNA的部分序列(94 bp).根据测序结果和鸡全基因组序列数据,结合生物信息学分析,结果获得了鸡U6 snRNA的全长序列(106 bp),该序列与人U6 snRNA序列相似性为100％,在鸡基因组中有4个拷贝,其中3个成簇存在于28号染色体上一段2 kb长的DNA片段上；另一个位于18号染色体.已有研究报道,这4个基因拷贝的5 ′侧翼区均具有启动子活性,说明它们是真基因.结果表明:这4个U6 snRNA基因启动子区均舍有潜在的远端序列元件(DSE)、近端序列元件(PSE)和TATA box等RNA聚合酶Ⅲ启动子元件.本研究成功获得了鸡U6 snRNA的全长序列,为选用U6基因作为内参基因开展鸡miRNA定量表达分析以及鸡U6基因的转录调控研究奠定基础.