沙地柏逆转座子的多样性分析

• 作者: 余利敏 张国盛 张文泉 张文波 林晓飞
• 来源期刊: 林业资源管理
• 学科: 农学
• 关键词: 沙地柏 逆转座子 逆转录酶 多样性
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 155-160
• 页数: 6页
• 分类号: S794.11|Q943.2
• 字数: 4054字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13466/j.cnki.lyzygl.2014.02.029

摘要

为了开发沙地柏(Sabina vulgaris)的逆转座子基因资源,分析其在沙地柏基因组中的多样性和系统进化关系,采用兼并-PCR技术克隆了22条Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列.所克隆的核苷酸序列除去两端引物后的长度范围为239～ 247bp,同源性范围为49.6％ ～ 98.4％,显示出较高的异质性.核苷酸聚类分析结果显示,该22条序列由5个家族组成;氨基酸序列分析结果显示,有7条序列出现终止密码子突变,4条序列表现移框突变;且将这些逆转录酶的氨基酸序列与其它物种同一类型逆转录酶的氨基酸序列进行聚类分析表明,它们可能与其它物种的Ty1-copia逆转录酶有共同的起源.以上研究结果证实了沙地柏基因组中逆转座子的多样性,可为进一步利用逆转座子进行沙地柏的品种鉴定和遗传多样性分析奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张国盛	内蒙古农业大学林学院	91	1245	20.0	31.0
2	林晓飞	内蒙古大学生命科学学院	8	28	4.0	5.0
3	张文波	内蒙古农业大学林学院	6	25	4.0	4.0
4	余利敏	内蒙古农业大学林学院	2	3	1.0	1.0