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摘要:
稻瘟病菌(Magnorthe oryzae)共有11个假定的Rab蛋白家族成员,本文选取了MoYpt51 (MGG_06241)和MoYpt52(MGG_01185)进行了生物信息学分析.通过搜索多个大型蛋白互作数据库和文献,共得到数百个与核心蛋白互作的蛋白和互作对.利用信息处理技术和高效制图平台将这些蛋白互作对构建成互作网络,得到若干个具有生物学意义的模块.结果表明,筛选得到的互作蛋白中,有的参与了蛋白降解的泛素途径(MGQ04053等)、囊泡介导的蛋白胞内运输(MGG_01238等),有的在蛋白、染色体的组装和修饰等过程(MGQ03677等)起重要作用.大部分假定互作蛋白定位于细胞质和质膜上,为其与目标蛋白互作提供了空间可能性.
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文献信息
篇名 稻瘟病菌MoYpt5蛋白互作网络预测
来源期刊 热带作物学报 学科 生物学
关键词 稻瘟病菌 MoYpt5蛋白 蛋白互作网络
年,卷(期) 2014,(8) 所属期刊栏目 作物病虫害及防治
研究方向 页码范围 1597-1604
页数 8页 分类号 Q71|Q291
字数 4310字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.08.025
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王宗华 福建农林大学生命科学学院 74 760 17.0 25.0
2 连璧 福建农林大学生命科学学院 3 5 1.0 2.0
3 周洁 福建农林大学生命科学学院 14 115 4.0 10.0
4 陈健 福建农林大学生命科学学院 2 5 1.0 2.0
5 党谢 福建农林大学生命科学学院 1 1 1.0 1.0
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稻瘟病菌
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蛋白互作网络
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