利用16S rRNA基因克隆文库技术分析德昌水牛瘤胃产甲烷菌的多样性

• 作者: 杨承剑 梁贤威 梁辛 邹彩霞 韦升菊
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 德昌水牛 瘤胃 产甲烷菌 16S rRNA 多样性
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产
• 页码范围: 382-388
• 页数: 7页
• 分类号: S823.8+3|S852.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2014.04.011

摘要

选取3头5岁左右的健康雌性德昌水牛作为试验动物,采用机械破壁法提取瘤胃内容物总DNA,用产甲烷菌特异性引物Met86F/Met1340R扩增16S rRNA基因,构建16S rRNA基因克隆文库,分析德昌水牛瘤胃产甲烷菌区系组成.结果表明:试验共获得99个16S rRNA基因序列,RDP分析表明94.2％的序列为甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter) 16S rRNA序列,按照97％的相似性划分为19个分类操作单元,其中96个序列(17个OTUs)占总序列的97.0％,与已知细菌的16S rRNA序列的相似性≥97％;3个序列(2个OTUs)占总序列的3.0％,与已知细菌16S rRNA序列的相似性为90％～97％;系统发育树分析表明,SGMT簇序列和RO簇序列所占总序列的比例分别为75.8％、1.0％,部分序列与Methanobrevibacter中任何已知相似序列都相隔较远,它们可能代表Methanobrevibacter中新的种.以上结果表明,德昌水牛瘤胃产甲烷菌以Methanobrevibacter产甲烷菌为优势菌群,其中有许多未培养的产甲烷菌需进一步分离培养,并对其功能进行分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁辛	中国农业科学院水牛研究所	32	210	5.0	14.0
2	梁贤威	中国农业科学院水牛研究所	49	224	9.0	13.0
3	韦升菊	中国农业科学院水牛研究所	24	144	7.0	11.0
4	邹彩霞	中国农业科学院水牛研究所	23	184	9.0	12.0
5	杨承剑	中国农业科学院水牛研究所	34	41	4.0	5.0