抗体CDR-H3区段的免疫信息学分析

• 作者: 刘冬娟 方慧生 李娟 游丽斌
• 来源期刊: 药物生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: CDR-H3 免疫信息学 氨基酸分布 治疗性抗体 Base区域 β-发夹
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 238-241
• 页数: 4页
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文

摘要

抗原结合部位亲和力是其组成氨基酸理化特性、结构特征的集中体现.CDR-H3位于抗体的抗原结合部位中心,构象多变.本研究从人抗体CDR-H3的氨基酸分布序列信息入手,同时选取12个FDA已批准上市的治疗性抗体药物来分析抗体CDR-H3区段的结构特点.结果显示人H3区段最高分布频率长度为12,出现概率最高的氨基酸为Tyr,Tyr、Trp、Ser、Thr、Gly 5种氨基酸有助于抗原结合部位构象的形成;所选取的抗体药物CDR-H3区段的长度n∈[7,14],Base区域构象均隶属于K构型,β-发夹结构氢键分布变化各异,其中芳香族氨基酸侧链和带电氨基酸分布对抗原结合具有重要促进作用.