药用植物苦参SSR-PCR体系的优化与验证

• 作者: 孙毅 杨武德 段永红 毕红园 渠云芳 王玉庆 王长彪
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苦参 SSR 优化 正交设计
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 页码范围: 95-100
• 分类号: S567
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2014.05.13

摘要

为有效利用SSR-PCR技术对药用植物苦参进行遗传多样性分析,采用正交设计L16(45)对影响苦参SSR-PCR体系的5个因素(Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP、引物)在4个水平上进行优化,PCR结果用DPS数据处理软件分析,筛选出各因素的最佳水平,建立适宜苦参SSR-PCR的反应体系和扩增程序,并选用内蒙古苦参对该体系进行稳定性验证.结果表明:在10 μL的苦参SSR-PCR体系中,模板DNA的用量为20.0 ng,Taq DNA聚合酶的用量为0.2～0.6 U,Mg2+的浓度为2.5 mmol/L,dNTPs浓度为0.1mmol/L,引物的浓度为0.6 μmol/L.扩增程序为:94℃预变性3m in;94℃变性1min,56℃退火45s,72℃1min,35个循环;72℃延伸10 min.4℃保存.选用12份苦参DNA对该体系进行稳定性验证,该体系具有较高的扩增稳定性,可用于药用植物苦参SSR标记的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨武德	山西农业大学农学院	97	1082	19.0	29.0
2	段永红	山西农业大学农学院	52	412	9.0	19.0
3	孙毅	山西省农业科学院生物技术研究中心	143	2581	25.0	44.0
5	王玉庆	山西农业大学农学院	22	221	8.0	14.0
6	王长彪	山西省农业科学院生物技术研究中心	32	211	8.0	13.0
7	渠云芳	山西农业大学农学院	32	211	7.0	14.0
10	毕红园	山西省农业科学院生物技术研究中心	10	59	4.0	7.0