大豆含硫氨基酸相关酶基因发掘

• 作者: 孟凡凡 王洋 王跃强 范旭红 邱红梅 郑宇宏 郝文媛 马晓萍 高淑芹
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 大豆 含硫氨基酸 合成途径 酶基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 934-942
• 页数: 9页
• 字数: 5544字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2014.0934

摘要

大豆(Glycine max)含硫氨基酸合成途径中的酶基因是含硫氨基酸组分的重要调控基因,发掘相关酶基因对高含硫氨基酸分子育种具有重要意义.文章采用大豆物理与遗传整合图谱,通过BioMercator2.1将113个含硫氨基酸合成途径酶基因及33个控制含硫氨基酸含量的QTL整合到遗传图谱Consensus Map 4.0上,依据酶基因位点与QTL的一致性以及QTL的效应值,初步筛选到16个与含硫氨基酸合成相关的候选基因.通过生物信息学方法对候选基因进行拷贝数、SNP、表达谱等分析,鉴定到12个相关酶基因,分别位于D1a、M、A2、K和G等8个连锁群上.生物信息学分析显示这些基因所在QTL可解释含硫氨基酸遗传变异的6.0％～38.5％,其中9个基因的间接效应值超过10％. 12个相关酶基因参与含硫氨基酸代谢的重要途径,且多在子叶、花中高丰度表达,存在丰富的SNP.这些基因可作为候选基因进行功能标记开发,将为大豆分子设计育种奠定基础.