基于元分析的大豆含硫氨基酸相关基因挖掘与信息学分析

• 作者: 于妍 侯云龙 厉志 孟凡凡 王跃强 邱红梅 郑宇宏 马晓萍 高淑芹
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 含硫氨基酸 元分析 Meta-QTL 候选基因
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 141-147
• 页数: 7页
• 分类号: S565.103
• 字数: 4885字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2015.02.003

摘要

提高含硫氨基酸组分是大豆品质改良的重要目标之一.本文借助Consensus Map 4.0高密度大豆遗传图谱,整合了33个含硫氨基酸QTL,并采用元分析方法,确定了8个含硫氨基酸Meta-QTL.通过QTL序列共线性区间分析,在Meta-QTL内筛选到7条用于候选基因发掘的基因组序列.利用基因功能注释,得到16个含硫氨基酸相关基因,包括6个氨基酸合成途径酶基因、1个11S大豆球蛋白A5A4B3亚基基因及9个调控基因.其中调控基因分别编码F-Box、PPR及转录因子3种蛋白.13个基因在NCBI数据库中分别有表达谱及SNP信息.大豆含硫氨基酸候选基因分析,可以为功能标记的开发和分子辅助育种提供有用信息.