荔枝古树胚性愈伤组织Fe-SOD成员基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 冯新 卢秉国 林玉玲 练从龙 赖钟雄
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 荔枝古树 胚性愈伤组织 Fe-SOD 克隆 可变剪接 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 74-81
• 页数: 8页
• 分类号: S667.1
• 字数: 5875字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.01.013

摘要

为了解Fe-SOD在荔枝古树胚性愈伤组织保存中的分子机制.选择荔枝古树“宋荔”花药诱导而来的胚性愈伤组织为试验材料,采用同源克隆和RACE方法,获得荔枝Fe-SOD的两个转录本和基因组序列,并对该基因组的内含子进行分析.克隆获得长1 285 bp含有完整开放阅读框的荔枝Fe-SOD核酸序列,其编码1个含有250个氨基酸的蛋白质,将该序列命名为LcFe-SOD7a.生物信息学分析结果表明:该蛋白为稳定的、亲水的、含跨膜结构域的偏酸性蛋白质,定位于微体(过氧化物酶体)和细胞质,具有多样的磷酸化位点.LcFe-SOD7a基因组序列长2 284 bp,含7个内含子,其中第4个内含子较长,达920 bp.同时还得到其中的1条内含子驻留型可变剪接基因.该可变剪接基因提前终止,仅编码207个氨基酸的蛋白质,将该可变剪接基因命名为Lc Fe-SOD7b.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	卢秉国	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	18	136	8.0	11.0
3	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0
4	冯新	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	8	43	5.0	6.0
5	练从龙	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	5	23	3.0	4.0