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家蚕空泡型ATP酶(V-ATPase)基因的基本信息及表达特征
家蚕空泡型ATP酶(V-ATPase)基因的基本信息及表达特征
作者:
吴用
李懿
王鑫
衣启营
谢康
赵萍
陈全梅
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
家蚕
V-ATP酶
系统进化
荧光定量PCR
丝腺
组织特异性表达
摘要:
【目的】鉴定家蚕(Bombyx mori)中的空泡型ATP酶(vacuolar-type ATPase, V-ATP酶)A、B亚基的编码基因,并调查其在家蚕幼虫5龄第3天不同组织和上蔟时期丝腺不同区段的表达特征。【方法】利用生物信息学的方法鉴定家蚕的V-ATP酶A、B亚基的编码基因并在线预测V-ATP酶两个亚基所具有的结构域,采用软件将其分别与其他物种中V-ATP酶A、B亚基的氨基酸序列进行同源序列比对和进化树的构建,通过荧光定量PCR技术分析家蚕V-ATP酶A、B亚基的编码基因在5龄第3天家蚕各组织的表达情况。进一步利用向家蚕幼虫上蔟时期的气孔注射pH值指示剂溴酚蓝,对丝腺进行染色,通过颜色变化对丝腺不同区段的pH值进行调查。最后,采用荧光定量PCR对家蚕上蔟时期丝腺不同区段V-ATP酶A、B亚基编码基因的表达情况进行分析。【结果】获得了家蚕V-ATP酶A、B亚基的编码基因BGIBMGA008295(GenBank登录号NM_001098359.1)和BGIBMGA002241(GenBank登录号NM_001098358.1)。结构域预测发现这两个亚基均具有3个非常保守的结构域,分别为位于N端的β筒结构域、序列中部的核苷酸结合结构域和 C 端结构域。将这两个基因编码的 V-ATP 酶 A、B 亚基的氨基酸序列与其他物种V-ATP 酶 A、B 亚基的氨基酸序列进行同源性比对和进化树的构建,同源比对结果发现不同物种中 V-ATP 酶 A、B亚基的氨基酸相似度为90%,保守结构域间相似度高达95%以上,说明不同物种间V-ATP酶A、B亚基高度保守。进化树显示家蚕V-ATP酶A、B亚基与同属于鳞翅目的其他昆虫的V-ATP酶A、B亚基亲缘关系较近。5龄第3天家蚕各组织中V-ATP酶A、B亚基编码基因的荧光定量PCR结果显示,这两个基因主要在中肠、脂肪体、生殖腺和丝腺中表达。使用溴酚蓝染色的方法分析上蔟期丝腺不同区段的pH情况,结果显示家蚕后部丝腺、中部丝腺后区和中区为中性或碱性环境,中部丝腺前区pH急剧下降到酸性环境,前部丝腺也为酸性环境。进一步对V-ATP酶A、B亚基编码基因在上蔟期丝腺不同区段进行表达情况分析,发现V-ATP酶A、B亚基基因在前部丝腺和中部丝腺前区高量表达,推测V-ATP酶可能与这两个区域低pH环境的产生和维持相关。【结论】明确了V-ATP酶在家蚕各组织的表达情况,V-ATP 酶可能与中部丝腺前区和前部丝腺腺腔的酸化相关,这为进一步研究 V-ATP 酶的生理功能提供了理论依据。
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文献信息
篇名
家蚕空泡型ATP酶(V-ATPase)基因的基本信息及表达特征
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
家蚕
V-ATP酶
系统进化
荧光定量PCR
丝腺
组织特异性表达
年,卷(期)
2014,(8)
所属期刊栏目
畜牧?兽医?资源昆虫
研究方向
页码范围
1611-1621
页数
11页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2014.08.017
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陈全梅
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室
5
12
3.0
3.0
2
王鑫
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室
22
64
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衣启营
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室
3
29
3.0
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4
谢康
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室
2
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李懿
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室
4
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吴用
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室
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引证文献(0)
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研究主题发展历程
节点文献
家蚕
V-ATP酶
系统进化
荧光定量PCR
丝腺
组织特异性表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
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