鸭mtDNA D-loop区部分序列和单倍型多样性分析

• 作者: 张扬 徐琪 段修军 董飚 陈国宏 黄正洋
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: mtDNA D-loop区 序列分析 单倍型分析 鸭
• 年，卷（期）: 2014,（13）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 12-15
• 页数: 4页
• 分类号: S834.2
• 字数: 2158字
• 语种: 中文

摘要

为寻找评价鸭科属间或品种间种质特性以及有效区分不同品种的工具,选取北京鸭、金定鸭、绿头野鸭、斑嘴鸭和番鸭共计40个个体,扩增其mtDNA D-loop区序列,最终获得家鸭616 bp有效序列,检测到6处插入/缺失,114次颠换,94次转换;获得番鸭619 bp有效序列,发现1处插入/缺失,4次转换,未发现颠换.利用MEGA5.0和DnaSP V.5.0等软件进行碱基组成、位点突变和单倍型分析.结果表明:鸭mtDNA D-loop区的碱基C的含量最高,并表现出了碱基组成的偏倚性;共检测到21种单倍型,Tajima's D值为-0.11344,符合中性突变,绿头野鸭和北京鸭的核苷酸多样度较高,遗传多样性丰富;番鸭的单倍型多样度(Hd=0.429)和核苷酸多样度(Pi=0.00139)均最低,其遗传多样性相对较低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈国宏	扬州大学动物科学与技术学院	393	3876	28.0	46.0
2	徐琪	扬州大学动物科学与技术学院	178	1010	15.0	26.0
3	张扬	扬州大学动物科学与技术学院	59	219	7.0	13.0
4	段修军		35	64	4.0	6.0
5	董飚		13	9	1.0	1.0
6	黄正洋	扬州大学动物科学与技术学院	10	36	4.0	5.0