葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 司风玲 张玉娟 胡甘雨 车燕飞 陈斌
• 来源期刊: 西南大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 葱蝇 过氧化氢酶 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 32-40
• 分类号: Q966
• 语种: 中文

摘要

过氧化氢酶(catalase,CAT)对昆虫的生长发育和代谢活动具有重要意义,是昆虫清除H2O2的关键酶.昆虫在滞育期间代谢速率很低,而CAT的活力与代谢强度有关,因此滞育期的昆虫是研究该酶的良好材料.本研究基于葱蝇转录组unigene序列信息,设计特异性引物并首次通过PCR技术克隆了葱蝇过氧化氢酶基因全长cDNA,命名为DaCAT,其全长为2 073 bp,开放阅读框1 518 bp,编码505个氨基酸,推测其相对分子质量为5.68×104,等电点为7.72.该研究对其进行了生物信息学分析并建立了系统发育树,分析表明该基因编码的氨基酸序列具有2个保守结构域及多个酶活性位点,与其他物种CAT具有较高的同源性,其中和拟果蝇Drosophila simulans亲缘关系最近,相似率为89.3％,采用SWISS-MODEL对其进行了蛋白质同源建模及3D结构预测分析,为进一步研究DaCAT基因在葱蝇滞育期间的代谢表达、酶活力测定以及具体功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈斌	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	73	290	9.0	15.0
2	司风玲	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	18	51	4.0	7.0
3	胡甘雨	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	1	3	1.0	1.0
4	车燕飞	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	4	15	3.0	3.0
5	张玉娟	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	19	84	5.0	8.0