文蛤过氧化氢酶的生物信息学分析

• 作者: 吴杨平 张志东 张雨 曹奕 李秋洁 田镇 陈爱华 陈素华
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 文蛤 过氧化氢酶 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 249-255
• 页数: 7页
• 分类号: Q544+.6
• 字数: 4392字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12113/j.issn.1672-5565.201904003

摘要

基于NCBI数据库,对文蛤过氧化氢酶基因(MmeCAT)进行生物信息学分析,旨在为文蛤过氧化氢酶的结构与功能的研究提供理论基础.结果表明,该基因编码511个氨基酸.文蛤过氧化氢酶分子量为58181.29 Da,分子式为C2588 H3928 O767 N730 S20,理论等电点为8.05,属亲水蛋白.带负电荷氨基酸残基数(Asp+Glu)为63个,带正电荷氨基酸残基数(Arg+Lys)为65个.假设所有半胱氨酸全部形成胱氨酸,其消光系数为63175 mol/L,相应的吸光度为1.086;假设所有的半胱氨酸均未形成胱氨酸时,消光系数为62800 mol/L,相应的吸光度为1.079;其半衰期为30 h,脂肪族氨基酸指数为57.28,不稳定系数为27.77(<40),可知文蛤过氧化氢酶为稳定蛋白质.亚细胞定位于过氧化物酶体,存在71个磷酸化位点和51个糖基化位点,无信号肽.二级结构以无规卷曲和α-螺旋为主,在物种进化上具有高度的保守性保守结构域预测表明,该基因编码蛋白可能属于典型单功能过氧化氢酶的第三分支.研究文蛤过氧化氢酶结构,能够为文蛤抗逆性品种选育提供理论基础.