板栗过氧化氢酶基因CAT1的克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴祖芳 张鑫 翁佩芳 苗英杰 葛颖
• 来源期刊: 食品工业科技
• 学科: 工学
• 关键词: 板栗 CAT1基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（13）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 124-129
• 页数: 6页
• 分类号: TS201.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2017.13.023

摘要

为研究板栗过氧化氢酶基因CAT1的功能,旨在为其采后贮藏中品质变化研究提供分子机理基础.以板栗为试材,提取总RNA,通过cDNA末端快速扩增技术(RACE),克隆到板栗CAT1基因cDNA全长,并对其进行生物信息学分析.结果表明,该基因序列全长1485 bp,包含一个1479 bp的开放阅读框,编码492个氨基酸.氨基酸序列分析表明,板栗CAT1与枣(Ziziphus jujuba)、烟草(Nicotiana tabacum)、陆地棉(Gossypium hirsutum)等植物过氧化氢酶CAT1氨基酸序列有较高的相似性.蛋白分析表明,该蛋白分子量为56947.31Da,理论等电点6.65,属稳定性亲水蛋白;亚细胞定位于过氧化氢酶体,存在30个磷酸化位点,无信号肽.二级结构以α螺旋、无规则卷曲为主.保守结构域预测表明,该基因编码蛋白属于Catalase-like超家族.本研究克隆获得了板栗CAT1基因,为进一步研究该基因的生物学功能奠定了基础.