DNA条形码揭示日本纺织娘(Mecopoda niponensis)个体内和个体间的序列变异

• 作者: 周志军 尚娜 常岩林 石福明
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 纺织娘 线粒体DNA DNA条形码线 粒体假基因 异质性
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 129-136
• 语种: 中文

摘要

采用DNA条形码通用引物对分布于我国的两种纺织娘14个个体进行了扩增与测定.结果显示,6个纺织娘Mecopoda elongata个体均可由PCR产物直接测序法获得良好测序结果,序列长度均为658 bp,且不存在碱基插入/缺失.而8个日本纺织娘M.niponensis个体PCR法直接测序结果峰图杂乱,软件无法识别,后经克隆法测定的85条克隆序列长度为580-662bp,其中,20条为明显的线粒体假基因(Nuclear sequences of mitochondrial origin,numts),包括4条存在终止密码子,15条存在碱基插入/缺失,1条存在读码框摆动;38条为疑似numts(含≥2个非同义替换位点).利用Kimura 2-parameter(K2P)模型计算遗传距离发现,两种纺织娘之间的遗传距离为0.077,纺织娘及日本纺织娘个体间的遗传距离分别为0-0.008及0.030-0.051,而日本纺织娘个体内克隆间的遗传距离则分别为0-0.143(含numts)及0-0.083(不含numts).邻接法系统发育树聚类结果显示,纺织娘形成一个单系分支,自举值为99,而日本纺织娘的COI和numts序列则聚类形成多个分支,提示这些numts序列可能是线粒体COI多次向核内转移的结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石福明	河北大学生命科学学院	57	219	7.0	12.0
2	周志军	河北大学生命科学学院	20	67	6.0	7.0
3	常岩林	河北大学生命科学学院	20	71	5.0	7.0