基于多视图融合的蛋白质功能模块检测方法

• 作者: ZHANG Aidong 张媛 贾克斌
• 来源期刊: 电子学报
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质相互作用网络 网络模块挖掘 多数据集成 可重叠聚类
• 年，卷（期）: 2014,（12）
• 所属期刊栏目: 学术论文
• 页码范围: 2337-2344
• 页数: 8页
• 分类号: TP39
• 字数: 6442字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0372-2112.2014.12.001

摘要

结合多种生物数据分析蛋白质相互作用网络（Protein-Protein Interaction Network，PPIN）中的功能模块结构，是目前蛋白质功能计算分析领域亟待解决的难题之一。本文提出了一种基于聚合非负矩阵分解（Collective Non-neg-ative Matrix Factorization，CoNMF）的多视图一致性功能模块检测方法，该方法同时逼近多视图数据，寻找统一的最优解达到对原多数据的最优近似。根据该统一解得到功能模块关系，同时该方法能够找到可重叠性的功能模块。实验结果显示本文所提出算法通过融合基因本体、基因表达谱与PPIN数据，在模块检测准确度上有一定提高，检测出的蛋白质功能模块具有真实生物意义。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贾克斌	北京工业大学电子信息与控制工程学院	119	1096	17.0	29.0
2	张媛	北京工业大学电子信息与控制工程学院	5	35	2.0	5.0