人preproEGF的mRNA/cDNA序列中SNPs及生物信息学分布探究

• 作者: 刘祖明 刘金伟 张兵 李方明 杨绍华 毛贵川 王兴林 陈海明
• 来源期刊: 中国医药导报
• 学科: 医学
• 关键词: 同位单核苷酸多态 人表皮生长因子前体蛋白 非同位单核苷酸多态 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 14-17,51,封2
• 页数: 6页
• 分类号: R786
• 字数: 2729字
• 语种: 中文

摘要

目的 探明单核苷酸多态(SNPs)在人表皮生长因子前体蛋白(preproEGF)mRNA/cDNA序列中的分布状况.方法 凭借美国生物信息中心(NCBI)平台和单核苷酸多态资料库(dbSNP)检索、分析、标注和图解相关SNPs在人preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的分布位点和生物信息学特征.结果 分布在人肾源和其他组织源preproEGF多肽mRNMcDNA序列中的SNPs总计有106个,其中84个同位SNPs大多数以外显子6～8、11～12、16～19和22～23为间隔并集中归位于第1～5、10、13～15、20～21、24外显子序列中,另外的22个非同位SNPs大多数以密集丛簇为特征而各自分布在两类序列3'端非编码序列中,但个别例外则单独归位于肾源类序列的第9外显子中.结论 SNPs在人两类preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的生物信息学分布、特征和图示对于SNP与疾病或性状的相关性研究及课题设计颇具参考价值.