新肺癌相关基因hERGIC3的克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘兴宇 吴明松 李学英 耿娜娜 郑翔
• 来源期刊: 现代医药卫生
• 关键词: 肺肿瘤 基因 克隆,分子 计算生物学
• 年，卷（期）: 2014,（16）
• 所属期刊栏目: 论 著
• 页码范围: 2404-2406,2409
• 页数: 4页
• 字数: 3394字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5519.2014.16.002

摘要

目的：构建hERGIC3基因的原核表达载体，并对其进行生物信息学分析，以期全面地了解hERGIC3蛋白的生物学功能。方法采用实时半定量聚合酶链反应（RT-PCR）方法获取人类hERGIC3基因的开放阅读框（ORF）框DNA序列插入pGEM-T Easy载体；选择多个软件对hERGIC3蛋白进行生物信息学分析。结果酶切结果显示，插入序列为目标序列，成功克隆了hERGIC3基因；生物信息学分析结果显示：hERGIC3蛋白由383个氨基酸残基组成，相对分子质量为43.2×103，理论等电点为5.68，蛋白比较稳定；hERGIC3为跨膜蛋白，跨膜区为20~42和345~367，膜外区域为1~19和368~383，膜内区域为43~344；二级结构含有110个α螺旋、94条延伸链、184个随机卷曲、15个潜在的磷酸化位点， hERGIC3可能参与了氨基酸、辅酶的生物合成以及脂肪、能量代谢和蛋白质翻译、转运等功能；hERGIC3含有ERGIC_N和COPⅡcoated_ERV 2个蛋白保守结构域，hERGIC3可能与PPKCSH、ERGIC1、ERGIC2、COPA、PSMD11等蛋白有相互作用。结论成功克隆了hERGIC3基因；深入地分析了hERGIC3的结构与功能，为下一步研究hERGIC3基因在肺癌中的病理生理功能奠定了理论基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李学英	遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室	79	328	11.0	14.0
2	吴明松	遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室	39	87	6.0	7.0
3	耿娜娜	遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室	12	31	2.0	5.0
4	郑翔	遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室	16	18	2.0	3.0
5	刘兴宇	遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室	4	9	2.0	3.0