鄱阳湖流域华溪蟹属 DNA 条形码

• 作者: 周宪民 张小燕 张萌 徐武杰 朱春潮 汪雁 白俊 石林波 邹节新
• 来源期刊: 南昌大学学报（理科版）
• 学科: 医学
• 关键词: 鄱阳湖流域 华溪蟹属 DNA 条形码 COI
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 页码范围: 402-408
• 页数: 7页
• 分类号: R38
• 字数: 4469字
• 语种: 中文

摘要

探讨 DNA 条形码分子标记作为华溪蟹属（Sinopotamon）淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本，采用线粒体 COI 和16S rRNA 基因片段以及 ITS2核基因片段，作为分子标记，结合 GenBank 数据库中同属序列片段，经 DNA 提取、引物筛选、PCR 扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析，在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹 DNA 条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上，16S rRNA 和 ITS2基因片段不适宜作为 DNA 条形码标准基因，而 COI 基因片段结合 GenBank 部分华溪蟹属序列数据分析，可区分本次研究所涉及的75％的物种。以线粒体 COI 基因片段为 DNA 条形码标准序列，可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。