采用PCR-DGGE技术分析蒙古羊瘤胃液相和固相细菌的多样性

• 作者: 倪学勤 唐雨蕊 曾东 曾燕 王剑 简平
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 蒙古羊 PCR-DGGE 液相 固相 聚类分析 PCA
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 131-136
• 分类号: S182
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2015.02.17

摘要

为探讨蒙古羊瘤胃液相和固相细菌的多样性,采用变性梯度凝胶电泳技术结合聚合酶链式反应(PCR-DGGE)及条带的克隆测序,比较瘤胃液相和固相细菌的差异,同时采用聚类分析和主成分分析(PCA)方法分析瘤胃液相和固相细菌的多样性.结果表明:1)瘤胃液相和固相样品均合有物种丰富的细菌菌群,但液相比固相具有更高的平均条带数,分别为30条和24条;2)瘤胃液相样品比固相样品具有更高的多样性指数、均匀度和丰富度,其数值分别为3.45、0.90和30.20及3.23、0.84和24.62:3)同一动物个体瘤胃液相样品和固相样品聚类在一起,相似性系数均高达0.81;4)共性条带测序结果表明瘤胃的优势细菌主要是Uncultured rumen bacterium和Uncultured Bacteroidetes bacterium,而特异性条带主要是Alcaligenes sp..不同动物个体的瘤胃液相和固相均含有丰富的细菌菌群,且物种丰富度均较高;同一动物个体的液相与固相相比具有更高的细菌多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐雨蕊		4	58	4.0	4.0