应用 PCR-DGGE技术比较绵羊瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃菌群的多样性

• 作者: 倪学勤 唐雨蕊 张艳 曾东 曾燕 祝辉
• 来源期刊: 动物营养学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绵羊 胃 细菌 PCR-DGGE 聚类分析 主成分分析
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 298-304
• 页数: 7页
• 分类号: S826
• 字数: 4217字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-267x.2015.01.036

摘要

本研究采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳( PCR-DGGE )技术结合DGGE 图谱条带的克隆和测序比较了绵羊瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃菌群的多样性,同时对菌群进行了聚类分析和主成分分析。结果表明：绵羊瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃内容物DGGE图谱的平均条带数分别为18、13、16和15条；瘤胃和瓣胃内菌群的多样性指数、均匀度和丰富度均较高,分别为2.83、0.79、17.00和2.82、0.79、16.80,而网胃和皱胃内容物较低,分别为2.52、0.70、12.60和2.73、0.76、15.40；聚类分析结果显示不同胃的内容物菌群具有一定差异,但不同动物个体相同胃的内容物相似性系数均高于0.63；PCR-DGGE 图谱中测序的条带大多数归为拟杆菌门( Bacte-roidetes)和厚壁菌门(Firmicutes),优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes)细菌、拟杆菌门(Bacte-roidetes)细菌、未培养瘤胃细菌( uncultured rumen bacterium)、未培养细菌( uncultured bacterium)和韦荣球菌科( Veillonellaceae)细菌,特异性细菌为不动杆菌属( Acinetobacter sp.)细菌和瘤胃球菌属( Ruminococcaceae)细菌。结果提示,绵羊4个胃中均含有种类丰富和数量巨大的细菌,且随着消化道部位由前往后的顺序,菌群的多样性呈现先高后降低再升高的趋势。