一株新的H9N9亚型禽流感病毒的全基因测序及分子特征分析

• 作者: 余慧燕 史智扬 周明浩 崔仑标 朱小娟 祁贤 葛以跃 郭喜玲 陈银
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 禽流感病毒 H9N9亚型 基因组 进化分析 重组
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 194-200
• 页数: 7页
• 分类号: R373.1
• 语种: 中文

摘要

目的 了解2013年华东地区活禽市场分离的一株H9N9亚型禽流感病毒(命名为:A/chicken/Changzhou/C08/2013)的分子特征,探讨该病毒的出现对新型H7N9亚型禽流感病毒防控的意义.方法 采用高通量测序技术对该分离株进行全基因组测序,MEGA6.0软件进行序列比对,采用邻近归并法(neighbor-joining)构建系统发生树进行基因特征分析.结果 A/chicken/Changzhou/C08/2013血凝素基因(HA)与上海鸡分离株A/chicken/Shanghai/1107/2013 (H9N2)的核苷酸一致性最高(99.2％),其HA基因裂解基序为VPSRSSR↓ GLF,呈典型低致病性禽流感病毒(AIV)分子特征;其余的基因则与新型H7N9亚型禽流感病毒的同源性较高(＞99.6％).结论 推测该H9N9病毒是由H9N2亚型AIV与新型H7N9亚型AIV发生重配的新型病毒,其HA基因来源于为H9N2亚型AIV,其他基因来源于新型H7N9亚型AIV,结果提示新型H7N9亚型AIV正在与禽中流行的其他亚型AIV进行重组,需要加强对AIV的持续监测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔仑标	江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病原微生物重点实验室	25	123	5.0	10.0
2	史智扬	江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病原微生物重点实验室	38	298	9.0	16.0
3	周明浩	江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病原微生物重点实验室	109	655	13.0	20.0
4	郭喜玲	江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病原微生物重点实验室	28	208	7.0	14.0
5	祁贤	江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病原微生物重点实验室	54	384	10.0	17.0
6	陈银	江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病原微生物重点实验室	7	18	3.0	4.0
7	葛以跃	江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病原微生物重点实验室	9	12	3.0	3.0
8	余慧燕	江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病原微生物重点实验室	11	12	2.0	3.0
9	朱小娟	江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病原微生物重点实验室	5	1	1.0	1.0