融合多机器学习方法的siRNA在线设计系统

• 作者: 张法 王璿 陈伟
• 来源期刊: 燕山大学学报
• 学科: 工学
• 关键词: siRNA 有效性预测 机器学习方法 在线设计
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 计算机科学与技术
• 页码范围: 458-463
• 页数: 6页
• 分类号: TP393|Q811
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-791X.2015.05.013

摘要

siRNA设计是RNAi研究中的一个重要部分.由于靶向基因可分割成数以千计的候选siRNA,找到其中最有效的siRNA具有一定的挑战性.本文融合特征分析研究成果和多机器学习方法,设计并实现了一个siRNA在线设计系统.将目标RNA的二级结构作为影响siRNA干扰效率的评分因素,以挑选靶向合适位置的siRNA序列.对于给定的目标基因,系统经过设计得出若干高效siRNA序列的沉默效率及其相关信息.实验测试结果表明,本系统具有较高的siRNA有效性预测精度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈伟	燕山大学信息科学与工程学院	14	64	5.0	7.0
3	王璿	燕山大学信息科学与工程学院	14	49	4.0	6.0
6	张法	中国科学院计算技术研究所	15	156	5.0	12.0