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摘要:
类黄酮-3'-羟化酶(F3'H)催化二氢堪非醇生成二氢栎皮黄酮,是花青素合成途径关键酶之一,主要参与决定植物花色、种皮和茎叶着色等性状。利用生物信息学手段对植物类黄酮-3'-羟化酶基因的序列和进化特征进行系统性分析。基因结构分析表明,植物F3'H基因外显子数变异范围为2~7,单子叶植物包括2个外显子,绝大多数双子叶与陆生低等植物具有3或4个外显子。蛋白序列分析显示,植物F3'H蛋白具有13个保守基序,其中10个保守基序与结构域p450相互重叠,其他3个保守基序具有种属特异性。进化分析表明,植物F3'H蛋白具有4个类群,在GroupⅠ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ亚群中分别检测到4、6、1、7个正选择位点(P>0.05),这些位点主要分布在F3'H蛋白不规则卷曲区,说明植物F3'H蛋白主要受控于纯净选择。利用滑动窗口方法发现,5对直系同源基因受到负选择作用,但4对旁系同源基因受到正选择作用,发生适应性进化。试验结果可为进一步研究植物F3'H基因功能及其关键氨基酸位点提供参考。
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文献信息
篇名 植物F3'H基因的序列与进化分析
来源期刊 东北农业大学学报 学科 农学
关键词 植物 花青素 类黄酮-3'-羟化酶 序列特征 进化
年,卷(期) 2015,(3) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 41-49
页数 9页 分类号 S641.2|Q78
字数 5189字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王红星 周口师范学院生命科学与农学学院 84 435 11.0 19.0
2 李俐俐 周口师范学院生命科学与农学学院 45 233 8.0 12.0
3 胡利宗 周口师范学院生命科学与农学学院 19 22 3.0 4.0
4 王秋霞 周口师范学院生命科学与农学学院 7 8 2.0 2.0
5 张佳慧 周口师范学院生命科学与农学学院 2 9 2.0 2.0
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23-1391/S
大16开
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14-47
1957
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