福州野生蕉FeSOD家族基因的克隆及在低温胁迫下的表达分析

• 作者: 冯新 徐蕾 林玉玲 谢晓清 赖恭梯 赖钟雄
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 福州野生蕉 FeSOD家族基因 可变剪接 低温胁迫 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 853-864
• 页数: 12页
• 分类号: Q785|Q786
• 字数: 8736字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2015.05.0853

摘要

以抗寒性较强的福州野生蕉为材料,采用RACE和RT-PCR扩增得到铁超氧化物歧化酶(FeSOD)家族基因(FeSOD)的2个成员共4条转录本,分别命名为MuFSD1A(登录号JX844026)、MuFSD1B(登录号KJ786318)、MuFSD1B-variant1(登录号KJ786319)和MuFSD1B-varia nt2(登录号KJ786320).MuFSD1A基因cDNA全长为1 277 bp,编码300个氨基酸;MuFSD1B基因cDNA全长为1 378 bp,编码260个氨基酸.基因结构分析表明MuFSD1B-variant1和MuFSD1B-variant2为MuFSD1B的可变剪接转录本.生物信息学和亚细胞定位分析显示,MuFSD1A和MuFSD1B主要定位于叶绿体,但他们的理化性质、磷酸化位点、蛋白结构等存在差异.序列比对分析发现MuFSD1A和MuFSD1B相似性仅为33.33％,但都具有保守的金属结合位点和FeSOD的特征氨基酸.进化树分析显示,MuFSD1A和MuFSD1B聚在不同的分支中.qRT-PCR分析表明,低温诱导MuFSD1A基因的表达而抑制MuFSD1B基因的表达,且MuFSD1A基因的相对表达量随着温度的降低而显著增加,说明该成员可能在香蕉抗寒中起主要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0
3	赖恭梯	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	14	106	7.0	10.0
4	冯新	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	8	43	5.0	6.0
5	徐蕾	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	4	29	3.0	4.0
6	谢晓清	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	2	9	1.0	2.0