苎麻 Genomic －SSR 与 EST －SSR 分子标记遗传差异性分析

• 作者: 刘晨晨 孙志民 栾明宝 王晓飞 许英 陈建华
• 来源期刊: 中国麻业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 苎麻 遗传差异性 分子标记 Genomic -SSR EST -SSR
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种?种质资源
• 页码范围: 57-63
• 页数: 7页
• 分类号: S563.1
• 字数: 3708字
• 语种: 中文

摘要

为了明确苎麻不同 SSR 的遗传差异性，利用 Genomic －SSR 与 EST －SSR 两种 SSR标记对19个苎麻核心种质的遗传多样性进行分析。根据统计结果，Genomic －SSR 平均检测到的观测等位基因数为3.4643、有效等位基因数为2.1982、Shannon 多样性指数为0.8864、观测杂合度为0.5254、期望杂合度为0.5172；EST －SSR 平均检测到的观测等位基因数为2.3333、有效等位基因数为1.9438、Shannon 多样性指数为0.7120、观测杂合度为0.5128、期望杂合度为0.4778。Genomic －SSR 和 EST －SSR 两种引物的有效等位基因数（Ne）和观测杂合度（Ho）差异不显著，Genomic －SSR 的 Shannon 指数显著高于 EST －SSR。研究结果表明，在标记多态性及基因型鉴别等方面，Genomic －SSR 与 EST －SSR 均具有显著的遗传差异性，但是两种标记都能有效的鉴别不同基因型个体。Genomic －SSR 可优先用于分子身份证、高密度遗传连锁图谱的构建和遗传多样性分析；EST －SSR 用来研究苎麻近缘种间的遗传多样性、进化分析、连锁图谱和比较基因组学更有优越性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许英	中国农业科学院麻类研究所	25	350	9.0	18.0
2	陈建华	中国农业科学院麻类研究所	26	350	10.0	18.0
3	孙志民	中国农业科学院麻类研究所	17	234	8.0	15.0
4	王晓飞	中国农业科学院麻类研究所	16	167	7.0	12.0
5	栾明宝	中国农业科学院麻类研究所	19	181	8.0	13.0
6	刘晨晨	中国农业科学院麻类研究所	1	7	1.0	1.0