应用抑制性差减杂交筛选鸭疫里默氏杆菌强弱菌株基因组的差异片段

• 作者: 于圣青 俞慧 倪欣涛 姜盼 孙冰清 崔俊生 欧长灿 祁晶晶 胡青海 邢林林
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭疫里默氏杆菌 抑制性差减杂交 基因组差异
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 细菌
• 页码范围: 24-29
• 页数: 6页
• 分类号: S852.612
• 字数: 3410字
• 语种: 中文

摘要

为了分析鸭疫里默氏杆菌(Riemerella anatipestifer, RA)强毒菌株HXb2和弱毒菌株NJ-1基因组之间的差异基因,以HXb2株基因组为待测菌株,以NJ-1株基因组为驱动菌株,构建了两株细菌基因组间的抑制性差减文库.经过dot-blot杂交和PCR验证,共鉴定到34个强弱毒株基因组差异片段.测定的序列经BLAST、DNAStar和PSORTb分析,结果表明有2个片段所在基因编码的蛋白为外膜蛋白,有2个片段所在基因编码的蛋白为胞质膜蛋白如磷酸盐转运蛋白,11个片段所在基因编码的蛋白为胞内蛋白如丙氨酸脱氢酶、β-内酰胺酶及一些假定蛋白等,有19个片段所在基因编码的蛋白(大部分为假定蛋白)定位未知.这些差异基因编码的蛋白可能与鸭疫里默氏杆菌的毒力及HXb2株特异蛋白等有关.本研究为下一步鉴定新的毒力基因及其他特异蛋白的功能奠定了基础.